BUKTI GENETIK IDENTITAS LOBSTER Panulirus versicolor BERDSASARKAN “DNA BARCODING”

Abstract

Penelitian ini bertujuan mengidentifikasi lobster Panulirus versicolor berdasarkan penanda genetik Cytochrome Oxidase Subunit I (COI) DNA mitokondria (mtDNA). Total 130 sampel lobster yang digunakan untuk mengidentifikasi spesies ini dengan DNA Barcoding. mtDNA genom lobster diisolasi menggunakan kit komersial, COI mtDNA diamplifikasi dengan PCR dan sekuensing menggunakan dideoksi Sanger. Hasil sekuensing gen COI mtDNA digunakan untuk menentukan identitas spesies menggunakan BLAST (basic local alignment search tools) (https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi?PROGRAM=blastn&PAGE_TYPE=BlastSearch&LINK_LOC=blasthome) dan BOLD System (http://www.boldsystems.org/index.php/IDS_OpenIdEngine). Kedua metode “DNA Barcoding” ini membuktikan bahwa semua sampel adalah P. versicolor. Bukti lain didapatkan dari jarak genetik yang sangat dekat antar sampel penelitian dengan P. versicolor genbank dan bold system. Hasil analisis filogenik sampel dengan P. versicolor juga menunjukkan bahwa semua sampel merupakan spesies P. versicolor. Halaman BIN (Barcode Index Number) dan spesies serta pohon filogenetik pada bold system membuktikan hal yang sama bahwa semua spesies penelitian adalah P. versicolor. Secara keseluruhan spesies P. versicolor yang sudah teridentifikasi secara morfologi didukung oleh hasil DNA Barcoding.