Abstract:
Tujuan penelitian ini adalah mengeksplorasi identitas dan menentukan keragaman genetik lobster Indonesia berdasarkan penanda molekuler mtDNA. Spesimen lobster dikoleksi dari Perairan BHS (n= 100), masing-masing dari Raja Ampat, Fakfak, Manokwari, Biak, Numamuran, Wasior, dan Nabire; sertaluar BHS (n=30), perairan Maluku dan Bali. Metode eksplorasi dan menentukan variasi genetik berdasarkan pendekatan genetika molekuler mulai dari isolasi DNA, PCR fragmen gen COI, sekuensing, dan analisis sekuens menggunakan berbagai software untuk mencapai tujuan. BLAST sekuens dan barkode DNA menunjukkan bahwa sampel penelitian merupakan spesies P. versicolor dengan tingkat kemiripan 98-100%. Keragamangenetik P. versicolor semua lokasi tergolong tinggi. Analisis genetik pada 130 sampel penelitian mengidentifikasi 37 haplotipe dengan nilai keragaman haplotipe 0,83 dan keragaman nukleotida 0,83. Seluruh P. versicolor dari tujuh populasi BHS (dan dua lokasi luar BHS) memiliki hubungan genetik yang sangat dekat dengan bukti pohon filogenetik (terdiri atas dua klade dengan perbedaan sangat rendah) dan jaringan haplotipenya. Jarak genetik antar individu di dalam satu populasi dan antar populasi penelitian antara 0.00–0.01. Sementara nilai Fst dan Nm berturut-turut adalah 0.09 dan 4.67.
